Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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PTPRDP23468 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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PTPRDP23468 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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PTPRDP23468 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
PTPRDP23468 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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