Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	ATP6V0E1P3-201	ENST00000420036	246 nt	BASIC	1.35	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	AL360175.1-201	ENST00000426547	285 nt	TSL 5 BASIC	1.35	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	MIR8063-201	ENST00000621930	81 nt	BASIC	1.35	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	Y_RNA.91-201	ENST00000363042	107 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	Y_RNA.233-201	ENST00000364407	101 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	Y_RNA.486-201	ENST00000384398	107 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	RNU6-768P-201	ENST00000384683	107 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	AL121914.1-201	ENST00000450188	156 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	RNU1-98P-201	ENST00000458992	160 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	RNU6-917P-201	ENST00000516294	104 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	Y_RNA.700-201	ENST00000516806	100 nt	BASIC	1.34	□□□□□ -2.19
TAF1	P21675	ZNF732-201	ENST00000419098	2193 nt	APPRIS P2 TSL 2 BASIC	1.34	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORD26-201	ENST00000384147	75 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SEPT7P4-201	ENST00000437076	306 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	CYCTP-201	ENST00000504253	315 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-322P-201	ENST00000516010	103 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-947P-201	ENST00000516264	106 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-1299P-201	ENST00000516316	100 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU7-25P-201	ENST00000516544	62 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR3668-201	ENST00000582138	75 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	FTX_2.1-201	ENST00000618816	94 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.622-201	ENST00000411091	108 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-165P-201	ENST00000517170	99 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AL512310.8-201	ENST00000550183	120 nt	BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SLC8A1-AS1-230	ENST00000627538	212 nt	TSL 5 BASIC	1.33	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.182-201	ENST00000363880	111 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.203-201	ENST00000364106	102 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-643P-201	ENST00000384018	107 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR624-201	ENST00000385217	97 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	snoU13.9-201	ENST00000458927	103 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-970P-201	ENST00000516312	107 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AC112693.2-201	ENST00000556538	232 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR4714-201	ENST00000580728	77 nt	BASIC	1.32	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.272-201	ENST00000364696	102 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-602P-201	ENST00000411155	105 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNX2P2-201	ENST00000424553	323 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AC074198.2-201	ENST00000508153	258 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORD116-25-201	ENST00000516517	92 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIPOL1-203	ENST00000537471	5954 nt	APPRIS P1 TSL 5 BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	ZGRF1-202	ENST00000309071	3347 nt	TSL 1 (best) BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.37-201	ENST00000362606	108 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.170-201	ENST00000363746	110 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.351-201	ENST00000365436	96 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORA24-201	ENST00000384096	131 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-209P-201	ENST00000384118	107 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORA27-201	ENST00000384323	126 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6ATAC2P-201	ENST00000387943	126 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR758-201	ENST00000390227	88 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-588P-201	ENST00000410281	105 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AC245047.7-201	ENST00000440265	293 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORD114-21-201	ENST00000606412	72 nt	BASIC	1.31	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.150-201	ENST00000363562	102 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.357-201	ENST00000365487	109 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.494-201	ENST00000384432	111 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR513C-201	ENST00000401352	84 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNA5SP127-201	ENST00000411051	133 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AL392103.1-201	ENST00000447000	198 nt	BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	TRAJ36-201	ENST00000614481	58 nt	APPRIS P1 BASIC	1.3	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-239P-201	ENST00000390990	99 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR548I3-201	ENST00000408378	149 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR548I1-201	ENST00000408810	149 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AC092783.1-201	ENST00000435832	231 nt	TSL 3 BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	AC087499.4-201	ENST00000448505	178 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNA5SP436-201	ENST00000516020	115 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	U8.5-201	ENST00000364528	136 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.270-201	ENST00000364693	104 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-1189P-201	ENST00000383958	107 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORA31.4-201	ENST00000516049	129 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-922P-201	ENST00000516753	99 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORA74.3-201	ENST00000517108	154 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR378D2-201	ENST00000580636	98 nt	BASIC	1.29	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RNU6-275P-201	ENST00000364910	107 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.374-201	ENST00000365606	101 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	Y_RNA.400-201	ENST00000383963	111 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	SNORD61-201	ENST00000384252	73 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR1185-1-201	ENST00000408598	86 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	RN7SKP88-201	ENST00000516847	250 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR3129-201	ENST00000581095	76 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	MIR4295-201	ENST00000585286	85 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	7SK.8-201	ENST00000612110	250 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	7SK.11-201	ENST00000615477	250 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	7SK.13-201	ENST00000622040	250 nt	BASIC	1.28	□□□□□ -2.2
TAF1	P21675	ZNF518A-210	ENST00000624776	7994 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	1.28	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	MIR342-201	ENST00000362212	99 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	MIR570-201	ENST00000384917	97 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	MIR802-201	ENST00000390235	94 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU6-955P-201	ENST00000410497	104 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU7-73P-201	ENST00000458743	63 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	snoU13.16-201	ENST00000459350	104 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	AC048334.1-201	ENST00000477975	159 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	AC131956.1-201	ENST00000506420	258 nt	TSL 2 BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU6-1219P-201	ENST00000516143	112 nt	BASIC	1.27	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	SNORA2.2-201	ENST00000365473	135 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	SNORA1-201	ENST00000384107	130 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	CPEB3_ribozyme.1-201	ENST00000408115	78 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	AL365434.1-201	ENST00000412362	380 nt	TSL 3 BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	AL353614.1-201	ENST00000445631	206 nt	TSL 5 BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU6-998P-201	ENST00000515894	101 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU6-958P-201	ENST00000516995	106 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21
TAF1	P21675	RNU6-902P-201	ENST00000517212	91 nt	BASIC	1.26	□□□□□ -2.21

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