Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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RRN3Q9NYV6 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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RRN3Q9NYV6 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RRN3Q9NYV6 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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