Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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