Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRAC1Q96KF2 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR4695-201ENST00000577305 74 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRAC1Q96KF2 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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