Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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ATG4CQ96DT6 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ATG4CQ96DT6 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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