Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
DDX54Q8TDD1 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
DDX54Q8TDD1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms