Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NLRC3Q7RTR2 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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