Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KNOP1Q1ED39 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KNOP1Q1ED39 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192 ms