Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SMN1Q16637 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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