Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CTF1Q16619 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CTF1Q16619 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms