Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FXNQ16595 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FXNQ16595 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FXNQ16595 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
FXNQ16595 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
FXNQ16595 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
FXNQ16595 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
FXNQ16595 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
FXNQ16595 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FXNQ16595 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms