Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NEDD8Q15843 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
NEDD8Q15843 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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