Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NPTX1Q15818 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NPTX1Q15818 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.1 ms