Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SF1Q15637 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SF1Q15637 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SF1Q15637 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SF1Q15637 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SF1Q15637 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF1Q15637 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF1Q15637 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF1Q15637 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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