Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SIX1Q15475 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SIX1Q15475 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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