Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NCAPHQ15003 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NCAPHQ15003 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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