Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ODF1Q14990 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ODF1Q14990 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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