Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SMCO1Q147U7 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMCO1Q147U7 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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