Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
UBE4AQ14139 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
UBE4AQ14139 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
UBE4AQ14139 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
UBE4AQ14139 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
UBE4AQ14139 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
UBE4AQ14139 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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