Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RUNX3Q13761 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RUNX3Q13761 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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