Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ATP1A4Q13733 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ATP1A4Q13733 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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