Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TUBB3Q13509 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TUBB3Q13509 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.8 ms