Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD4Q13485 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD4Q13485 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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