Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TOP3AQ13472 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TOP3AQ13472 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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TOP3AQ13472 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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TOP3AQ13472 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TOP3AQ13472 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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