Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
TCOF1Q13428 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TCOF1Q13428 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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