Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
MRPL49Q13405 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MRPL49Q13405 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms