Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms