Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
ATMQ13315 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
ATMQ13315 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
ATMQ13315 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
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