Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ERCC8Q13216 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
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ERCC8Q13216 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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ERCC8Q13216 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ERCC8Q13216 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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