Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CSTF3Q12996 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CSTF3Q12996 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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