Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
FOXF2Q12947 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXF2Q12947 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms