Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GTF3C1Q12789 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms