Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CKAP4Q07065 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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CKAP4Q07065 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CKAP4Q07065 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CKAP4Q07065 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CKAP4Q07065 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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