Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHRNEQ04844 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNEQ04844 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms