Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ERVPABLB-1P60509 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ERVPABLB-1P60509 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERVPABLB-1P60509 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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