Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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PTPRMP28827 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PTPRMP28827 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPRMP28827 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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PTPRMP28827 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
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PTPRMP28827 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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