Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
LRRTM2O43300 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LRRTM2O43300 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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