Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CRXO43186 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CRXO43186 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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