Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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RRN3Q9NYV6 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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RRN3Q9NYV6 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RRN3Q9NYV6 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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RRN3Q9NYV6 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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RRN3Q9NYV6 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RRN3Q9NYV6 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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