Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PHACTR1Q9C0D0 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PHACTR1Q9C0D0 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PHACTR1Q9C0D0 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PHACTR1Q9C0D0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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