Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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FOXQ1Q9C009 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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FOXQ1Q9C009 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXQ1Q9C009 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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