Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CPEB1Q9BZB8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CPEB1Q9BZB8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms