Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATG4CQ96DT6 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ATG4CQ96DT6 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ATG4CQ96DT6 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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