Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NLRC3Q7RTR2 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NLRC3Q7RTR2 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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