Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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NFIL3Q16649 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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NFIL3Q16649 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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NFIL3Q16649 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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NFIL3Q16649 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NFIL3Q16649 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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NFIL3Q16649 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFIL3Q16649 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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