Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SLC18A3Q16572 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SLC18A3Q16572 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.9 ms