Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CNGA3Q16281 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNGA3Q16281 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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