Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
VAMP3Q15836 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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VAMP3Q15836 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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VAMP3Q15836 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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VAMP3Q15836 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
VAMP3Q15836 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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