Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC85BQ15834 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CCDC85BQ15834 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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